Se puede cambiar el número de facturación desde el menú de ajustes: 

Busca la opción de Último Nº de factura. Si el último numero es el 123, quiere decir que la siguiente factura será la 124. Por lo tanto si necesitas que la nueva factura que vas a hacer sea la 546, deberás escribir en Último Nº de factura el 545.
Acuérdate luego de cambiar la numeración a la que tenías.